Etiologi abses paru dapat dibedakan menjadi etiologi primer dan sekunder. Abses paru primer disebabkan oleh aspirasi sekret orofaringeal, pneumonia nekrotikans, ataupun imunodefisiensi. Sementara itu, abses paru sekunder dapat disebabkan oleh obstruksi bronkial, penyakit paru lain, penyebaran patogen secara hematogenik, atau penyebaran patogen secara langsung dari infeksi di lokasi lain.[2]

Aspirasi sekret orofaringeal dapat berasal dari infeksi dental, sinusitis, gangguan kesadaran, atau gastroesophageal reflux disease (GERD). Penyebaran hematogenik dapat terjadi pada pasien dengan sepsis abdominal, endokarditis infektif, dan septik thromboembolisme. Penyakit paru yang bisa menyebabkan abses adalah bronkiektasis, kistik fibrosis, obstruksi bronkial, malformasi kongenital, dan fistula bronkoesofageal.[2]

Abses paru dapat mengandung hanya satu bakteri maupun beberapa bakteri sekaligus (polimikrobial). Studi terdahulu menyebutkan bahwa secara mikrobiologi, kebanyakan abses paru (90%) disebabkan oleh bakteri anaerob.[6,8]