Pengawasan klinis perlu dilakukan pada pasien yang menerima terapi lansoprazole dengan durasi terapi yang lama. Hipomagnesemia dapat terjadi dan dapat mengarah ke tetanus, aritmia, dan kejang, terutama jika pasien juga mengonsumsi obat lain yang menurunkan kadar magnesium, seperti digoxin. Pemeriksaan kadar magnesium serum perlu dilakukan. Penghentian terapi harus dihentikan jika terjadi hipomagnesemia.[6]

Studi observasional menyatakan bahwa terapi PPI, terutama jika lebih dari 1 tahun dapat berkaitan dengan risiko fraktur akibat osteoporosis. Oleh karena itu, setiap pasien harus menerima terapi dengan dosis efektif terkecil dengan durasi terapi sesingkat mungkin.[6]