Indikasi penilaian fontanel adalah untuk memantau pertumbuhan bayi dan juga menilai tanda penyakit tertentu pada bayi seperti tanda-tanda dehidrasi, peningkatan tekanan intrakranial, rickets, achondroplasia, dan Down syndrome.

Fontanel yang menonjol dapat merupakan tanda peningkatan tekanan intrakranial yang disebabkan oleh tumor intrakranial, hydrocephalus, perdarahan intrakranial, ensefalitis, atau meningitis. Di lain sisi, fontanel yang cekung dapat merupakan tanda dehidrasi. Ukuran fontanel yang lebih besar dari normal atau terlambat menutup juga dapat merupakan tanda kelainan seperti achondroplasia, hipotiroid kongenital, Down syndrome, dan rickets. Sementara itu, ukuran fontanel yang lebih kecil dari normal atau menutup terlalu cepat dapat merupakan tanda kraniosinostosis atau perkembangan otak yang abnormal.[1,3,5]