Benjolan pada leher dapat disebabkan oleh neoplasma maupun non neoplasma. Misalnya saja benjolan pada kelenjar tiroid, akan menimbulkan pertanyaan apakah massa ini adalah sebuah nodul koloid, tiroiditis autoimun, goiter toksik,  atau keganasan (seperti limfoma, karsinoma tiroid papiler, medular, atau anaplastik). Oleh karena itu, pemeriksaan FNAB diindikasikan untuk menunjang diagnosis pada massa colli dan dapat menentukan arah terapi. Pada kasus massa colli, FNAB juga dapat digunakan untuk menentukan staging dari limfoma Hodgkin dan Non-Hodgkin. [4,8]

Limfadenopati

Pemeriksaan FNAB sering dipilih sebagai penunjang untuk mengevaluasi limfadenopati. Ditemukannya limfadenopati secara klinis menimbulkan beberapa diagnosis banding. Pembesaran kelenjar getah bening ini dapat menandakan adanya metastasis, limfadenitis, transformasi limfoma, dan hiperplasia reaktif. FNAB berfungsi sebagai pemeriksaan sitologi untuk membedakan diagnosis banding tersebut. Selain pemeriksaan sitologi, hasil aspirasi dapat juga digunakan sebagai sampel kultur, studi immunophenotyping, dan juga studi molekular. [3,5]

Kelenjar Saliva

Kelenjar saliva merupakan jaringan yang mudah diakses dengan metode FNAB. Pengambilan sampel pada kelenjar saliva dapat membedakan antara lesi inflamatorik, lesi benigna, lesi maligna, atau lesi kistik. [6]

Massa Payudara

FNAB perlu dilakukan untuk menentukan apakah massa pada payudara mengarah kepada sebuah keganasan atau merupakan sebuah lesi yang jinak, sebelum intervensi yang lebih invasif dilakukan. Sebuah meta analisis oleh Yu et al yang menganalisis 46 studi menyebutkan bahwa FNAB memiliki nilai sensitivitas dan spesifisitas yang tinggi (92,7% dan 94.8%) untuk mendeteksi kanker payudara. Walaupun demikian, pemeriksaan FNAB jika ditambah dengan evaluasi klinis dan mamografi, akan memberi nilai diagnostik yang lebih akurat dan mengurangi risiko tidak terdeteksinya kanker payudara menjadi <1%. [7]