Patofisiologi epididimitis dapat bersifat infeksius atau noninfeksius. Epididimitis infeksius umumnya diakibatkan oleh infeksi saluran kemih yang menyebar ke epididimis, sedangkan yang tidak berhubungan dengan infeksi belum diketahui secara pasti.[2,3,5,6]

Epididimitis Infeksius

Infeksi bakteri sampai sekarang merupakan penyebab yang paling sering ditemukan pada pasien epididimitis. Epididimitis umumnya terjadi akibat infeksi menular seksual, seperti  infeksi klamidia dan gonorrhoeae, yang kemudian diikuti dengan migrasi patogen ke traktus genitourinaria.[2,5]