Biopsi kulit jarang memiliki kontraindikasi mutlak tetapi mungkin memiliki beberapa kontraindikasi relatif yang harus dievaluasi terlebih dahulu sebelum tindakan untuk mencegah komplikasi. Contohnya adalah riwayat alergi dan gangguan perdarahan.

Evaluasi prabiopsi meliputi riwayat alergi pasien terhadap anestesi lokal, ada tidaknya infeksi yang sedang berlangsung di area biopsi, riwayat gangguan perdarahan pasca pembedahan terdahulu, dan pemakaian obat yang bisa memengaruhi hemostasis.[3,4]

Kontraindikasi relatif biopsi kulit adalah lesi yang terletak di dekat struktur anatomi yang rentan, seperti saraf dan pembuluh darah besar, serta kapsul sendi. Struktur-struktur di bawah lokasi biopsi, seperti neurovascular bundle dan cairan spinal juga perlu diperhatikan sebelum melakukan biopsi kulit.[8]