Pengawasan klinis yang perlu dilakukan dalam penggunaan budesonide antara lain adalah tekanan darah, kadar gula darah, elektrolit, peak flow, forced expiratory volume (FEV1), dan uji fungsi paru lain. Diperlukan juga pemeriksaan densitas mineral tulang, fungi hepar, dan pertumbuhan pada anak untuk penggunaan jangka panjang. Hal ini semua terkait risiko efek samping dari budesonide seperti hiperglikemia, osteoporosis, dan keterlambatan pertumbuhan.

Pada kondisi penggunaan jangka panjang, perlu diperhatikan adanya tanda-tanda supresi adrenal, infeksi, perubahan penglihatan, dan kandidiasis oral.[4,8]