Pengawasan klinis yang perlu dilakukan pada pengguna mupirocin adalah ada tidaknya reaksi alergi dan bagaimana respons klinis yang didapatkan. Mupirocin umumnya digunakan selama 10 hari. Jika pasien tidak menunjukan respons klinis yang baik setelah penggunaan 3–5 hari, lakukan evaluasi ulang dan curigai resistansi.[6,7]

Mupirocin umumnya digunakan untuk terapi infeksi kulit seperti impetigo dan juga untuk dekolonisasi nasal. Obat ini hanya diabsorpsi secara minimal setelah pemberian topikal, sehingga umumnya tidak menyebabkan efek samping sistemik. Efek samping yang terjadi umumnya bersifat lokal, misalnya rasa perih dan ruam kulit. Namun, pernah ada laporan efek samping serius berupa anafilaksis, urtikaria, dan angioedema.[6,7]