Tidak ada kontraindikasi pemeriksaan electroencephalography/EEG, bila prosedur dilakukan secara tepat. Pemeriksaan ini merupakan prosedur noninvasive sehingga tidak memiliki risiko membahayakan pasien.[1,8]

Sebaiknya pemeriksaan EEG tidak dilakukan kepada pasien yang membutuhkan terapi oksigen dengan konsentrasi tinggi. Hal tersebut karena arus listrik pada mesin EEG dapat menyalakan api saat bersinggungan dengan oksigen sehingga dapat terjadi kebakaran.[1,8]