Patofisiologi kandidiasis oral adalah infeksi fungal Candida sp. Spesies Candida yang paling sering ditemukan di kavitas oral adalah Candida albicans.[3,5]

C. albicans adalah jamur dimorfik yang merupakan flora normal kavitas oral. Flora normal ini dapat menjadi patogen ketika terdapat faktor predisposisi, misalnya kebersihan oral yang buruk, merokok, xerostomia, dan gangguan imunologi.[3,5]

Patogenesis infeksi Candida sp telah dilaporkan pada tahun 2011. Candida sp mengeluarkan protein berupa secreted aspartyl proteinases (SAPs) yang menginvasi mukosa dan menyebabkan peradangan. Sekresi ekstraseluler SAP memerlukan gen protein prevakuola atau vacuolar protein sorting 4-A (VPS4A) yang merupakan kunci dari infeksi kandidiasis.[6]