Patofisiologi degenerasi makula belum dipahami secara baik, namun penelitian-penelitian yang ada mengaitkan faktor genetik, jalur biokimia serta sistem komplemen dengan perjalanan penyakit ini.

Teori-teori yang ada sekarang terutama berfokus pada proses yang terjadi di lapisan epitel pigmen retina, fotoreseptor, dan kompleks membran Bruch. Epitel pigmen retina atau retinal pigmen epithelium (RPE) adalah lapisan yang penting untuk menunjang metabolisme dan fungsi lapisan fotoreseptor retina serta memiliki fungsi fagositosis.

Saat proses penuaan terjadi, fungsi sel-sel di lapisan ini berkurang sehingga terjadi akumulasi residu metabolisme dari segmen luar fotoreseptor di intraselular epitel pigmen retina dalam bentuk lipofusin.