Patofisiologi kondiloma akuminata atau kutil kelamin (genital wart) dimulai dari invasi virus Human papillomavirus (HPV) tipe 6 dan 11 pada stratum basal epidermis. Invasi virus umumnya melalui mikroabrasi pada kulit dan mukosa. Masa inkubasi HPV setelah transmisi adalah 3 bulan – 2 tahun sampai menampilkan morfologi kondiloma akuminata.[2,5]

Virologi HPV

Genom virus terdiri atas 6 early-open reading frames (E1, E2, E4, E5, E6, E7) dan 2 late-open reading frames (L1, L2). Pada HPV, gen early-open reading frames berperan penting sebagai fungsi regulasi, mengatur replikasi virus dan transformasi sel. Sedangkan gen  late-open reading frame mengatur protein kapsid virus. Pada akhirnya, melalui bantuan protein kapsid L1 dan L2, partikel virus yang telah selesai ter-replikasi siap untuk menginfeksi sel epitel host yang masih sehat.[2,5]