Patofisiologi nevus sebaceous masih belum diketahui pasti tetapi dikaitkan dengan terjadinya mutasi somatik postzygotic yang menyebabkan berbagai ekspresi klinis mosaicism.

Nevus sebaceous dianggap sebagai sindrom kelainan genetik yang mempengaruhi RAS-mitogen activated protein kinase pathway yang berfungsi mengontrol tumorigenesis dan pertumbuhan sel.[4]

Mutasi somatik dapat terjadi pada salah satu dari beberapa gen, seperti HRAS, KRAS, dan NRAS. Dalam satu penelitian, dilaporkan bahwa 95% kasus nevus sebaceous berkaitan dengan mutasi pada HRAS dan 5% dengan mutasi pada KRAS. Mutasi yang menyebabkan nevus sebaceous tidak diwariskan dan hanya terdapat di beberapa sel tubuh.[1]