Halo dok... terima kasih atas pertanyannya

Untuk mengetahui secara patognomonis pasien terinfeksi varian omicron atau delta tidak dapat dideteksi dengan metode RT PCR yang dilakukan rutin saat ini karena sama-sama menunjukkan hasil PCR yang positif.

Namun untuk varian omicron, ada suatu metode skrining khusus (yang dapat dilakukan di lab dengan fasilitas RT PCR untuk Covid19 biasa tetapi menggunakan kit dan probe tertentu) yaitu skrining SGTF (S gene target failure)  karena dapat mendeteksi delesi pada posisi 67 dan 70 sekuens spikes... Namun karena deteksi tersebut juga dapat terjadi pada varian lain misalnya varian alfa, maka SGTF tersebut hanya berupa skrining saja,,, gold standard nya atau identifikasi pastinya tetap harus dengan WGS (whole genome sekuensing) dan WGS saat ini di Indonesia hanya dapat dilakukan di senter2 tertentu karena pada WGS ini dipetakan seluruh gen (genom) dari SARS CoV2.