Patofisiologi koarktasio aorta terkait erat dengan suatu kelainan kongenital namun proses embriologi terkait dengan koarktasio belum sepenuhnya dipahami. Meskipun demikian, terdapat 2 teori paling umum yang menjelaskan patogenesis kondisi ini. Teori tersebut adalah teori hipotesis hemodinamik dan ectopic ductal tissue.[3,7]

Hipotesis Hemodinamik

Teori patofisiologi koarktasio aorta yang pertama ini menjelaskan bahwa perkembangan abnormal aorta terjadi karena penurunan aliran darah melalui bagian isthmus aorta selama perkembangan janin di uterus.[3,7]