Pedoman klinis adalah sebelum pemeriksaan mamografi dilakukan, dokter harus menjelaskan kepada pasien mengenai indikasi pemeriksaan dan kontraindikasi seperti riwayat alergi terhadap kontras atau penurunan fungsi ginjal. Kondisi menyusui mengharuskan ibu untuk mengosongkan payudara terlebih dahulu sebelum dilakukan pemeriksaan mamografi.

Dokter sebaiknya mengkonfirmasi ulang siklus menstruasi pasien karena prosedur mamografi paling baik dilakukan pada hari ke 7-10 dari hari pertama menstruasi terakhir, untuk mengurangi rasa tidak nyaman akibat penekanan payudara saat pemeriksaan mamografi. Dokter juga dapat menjelaskan risiko dan efek samping selama pengambilan gambar bahwa pasien akan merasa sedikit tidak nyaman hingga nyeri karena adanya penekanan pada payudara selama pengambilan gambar.

Terdapat beberapa kondisi khusus yang perlu diperhatikan dalam pemeriksaan ini, yaitu  adanya implan payudara yang membutuhkan teknik pengambilan gambar dengan sudut khusus atau metode skrining lainnya. Kondisi kehamilan menyebabkan mamografi sebaiknya ditunda hingga memasuki masa trimester ketiga akhir. Memakai pelindung perut untuk melindungi janin selama pengambilan gambar juga dapat dipertimbangkan pada kondisi kehamilan.