Kontraindikasi utama vitrektomi adalah pasien dengan visus tidak ada persepsi cahaya (buta total) karena prosedur ini sama sekali tidak memiliki manfaat pada kondisi tersebut.

Kontraindikasi lain dari vitrektomi adalah:

1. Pasien yang diperkirakan memiliki prognosis kebutaan sangat tinggi
2. Pasien yang diduga memiliki kondisi keganasan yang aktif karena pada kondisi ini bila dilakukan insisi akan meningkatkan risiko terlepasnya sel ganas secara sistemik